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プベルル酸の毒性予測と治療薬への可能性の模索【in silico創薬】【ligand-based screening】 - LabCode

Ligand-based screeningとは リガンドベースのスクリーニング(Ligand-based screening)は、薬剤発見において、既知の活性リガンド(分子)の化学的特性や構造を利用して、毒性予測や類似化合物検索などを行う手法です。 本記事ではまずプベルル酸の腎毒性を予測します。 その後類似性探索を使って、プベルル酸の標的タ...

OpenTelemetry Collector導入の実践編とその後 - Gaudiy Tech Blog

はじめまして。Gaudiyでエンジニアをしているあんどう(@Andoobomber)です。 以前、「OpenTelemetry Collector導入のPoCと今後に向けて」という記事を弊エンジニアの sato(@yusukesatoo06)より公開しました。簡単に記事を要約すると、 OpenTelemetry及びOpenTelemetry Collectorの説明 実際にPoCを作ってみる 実導入...

Python Interview Questions

Here is a list of common Python interview questions with detailed answers to help you prepare for the interview as a Python developer. Python, with its versatile use cases and straightforward syntax, has seen its popularity growing continuously in software development, data science, artificial in...

最新の Google Gemma モデルを MLX を使ってローカルでファインチューニング|alexweberk

今回は、最新の Google Gemma モデルを Apple Silicon に最適化されたライブラリ MLX を使ってローカルで実行したり、ファインチューニングしてみましたのでその手順を紹介します。 MLX 関連の情報はドキュメンテーションが分かりづらいものも多かったので色々試した経緯も共有しながら少しでも何かの参考になれば幸いで...

VSCodeでC言語プログラミング事始め HelloWorldがnmakeできるまで - Qiita

はじめに 諸般の流れからC言語を使う機会が増えてきたので、あらためてVSCodeでC言語プログラミングができる環境構築を再確認しておきます。諸般の事情でWindows+MSCです。今回はmakefileを使ってHelloWorldがビルドできる状況を確認します。HelloWorld単体をビルドするのにmakefileを使うことはあまり意味のないことか...

【分子ドッキング】 SwissDockを使ったタンパク質-低分子ドッキング【in silico創薬】 - LabCode

本記事を進むにあたって、UCSF Chimeraのダウンロードをお願いします。 分子ドッキングとは? 分子ドッキングは薬物開発において重要な手法です。これは、タンパク質などの大きな分子と小さな分子(潜在的な薬物)との相互作用をコンピュータ上でシミュレートする過程です。分子ドッキングは、薬物がターゲットとなるタ...

PyPIを悪用した攻撃グループLazarusのマルウェア拡散活動 - JPCERT/CC Eyes

JPCERT/CCでは、攻撃グループLazarusが不正なPythonパッケージを公式PythonパッケージリポジトリーであるPyPIに公開していることを確認しました(図1)。今回確認したPythonパッケージは以下のとおりです。 pycryptoenv pycryptoconf quasarlib swapmempool pycryptoenvやpycryptoconfは、Pythonで暗号化アルゴリズムを...

【機械学習】機械学習を用いたin silico screening【AI創薬】~第5/5 章 候補化合物のin silico screening~ - LabCode

AI創薬とは? AI創薬は、人工知能(AI)技術を利用して新しい薬物を発見、開発するプロセスです。AIは大量のデータを高速に処理し、薬物の候補を予測したり、薬物相互作用を評価したりします。また、AIは薬物の効果や安全性をシミュレートすることも可能で、臨床試験の前の段階でリスクを評価することができます。これに...

【機械学習】機械学習を用いたin silico screening【AI創薬】~第4/5 章 予測モデルの作成~ - LabCode

AI創薬とは? AI創薬は、人工知能(AI)技術を利用して新しい薬物を発見、開発するプロセスです。AIは大量のデータを高速に処理し、薬物の候補を予測したり、薬物相互作用を評価したりします。また、AIは薬物の効果や安全性をシミュレートすることも可能で、臨床試験の前の段階でリスクを評価することができます。これに...

【機械学習】機械学習を用いたin silico screening【AI創薬】~第3/5 章 機械学習データの整形~ - LabCode

AI創薬とは? AI創薬は、人工知能(AI)技術を利用して新しい薬物を発見、開発するプロセスです。AIは大量のデータを高速に処理し、薬物の候補を予測したり、薬物相互作用を評価したりします。また、AIは薬物の効果や安全性をシミュレートすることも可能で、臨床試験の前の段階でリスクを評価することができます。これに...


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